More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2523 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  319  9e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.82345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  92.41 
 
 
158 aa  296  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.87405e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  87.9 
 
 
158 aa  287  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  87.34 
 
 
158 aa  287  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.82493e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  87.34 
 
 
159 aa  282  1e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.08338e-13  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  85.44 
 
 
158 aa  281  3e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  85.44 
 
 
158 aa  280  6e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
158 aa  238  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 
157 aa  180  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
172 aa  178  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 
160 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 
160 aa  178  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
157 aa  178  3e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  55.56 
 
 
158 aa  178  3e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
168 aa  176  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 
158 aa  174  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  174  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  54.9 
 
 
157 aa  173  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
159 aa  173  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 
158 aa  173  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  54.84 
 
 
158 aa  173  1e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 
158 aa  172  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  54.3 
 
 
152 aa  172  2e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 
166 aa  171  3e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
158 aa  171  3e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
176 aa  171  3e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 
157 aa  171  4e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
158 aa  171  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
158 aa  170  6e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 
158 aa  170  6e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  170  7e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  53.59 
 
 
158 aa  170  8e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  55.48 
 
 
158 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 
166 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
158 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 
166 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  53.55 
 
 
158 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
158 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
168 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  53.29 
 
 
152 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
158 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 
158 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
158 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 
158 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 
158 aa  167  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 
158 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
159 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
158 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  53.21 
 
 
158 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  51.27 
 
 
173 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 
158 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 
158 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
158 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 
158 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 
158 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 
158 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 
171 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 
159 aa  164  3e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 
203 aa  164  3e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 
157 aa  164  3e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
174 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 
158 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
158 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
158 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  52.9 
 
 
180 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 
157 aa  164  6e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 
158 aa  164  6e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 
158 aa  164  6e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 
168 aa  163  7e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
165 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  53.59 
 
 
160 aa  162  1e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
158 aa  162  1e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 
158 aa  162  2e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 
158 aa  162  2e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 
156 aa  162  2e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
173 aa  162  2e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  53.85 
 
 
158 aa  162  2e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 
157 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
160 aa  161  4e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 
179 aa  161  4e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
160 aa  161  4e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
157 aa  160  5e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>