216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1815 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 		 308 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  85.23 
 
 		 299 aa  549  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  63.21 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  55.02 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  56.51 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  49.46 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  49.29 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  45.94 
 
 		 418 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  45.79 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  45.42 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  42.61 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  39.87 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  39.26 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  36.29 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  35.89 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  38.25 
 
 		 373 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.97 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  24.27 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  25.23 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  26.94 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  25.45 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.23 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  25.23 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.39 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.45 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.02 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  23.66 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.28 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  24.06 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  24.06 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.02 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  24.02 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  25.51 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  25.25 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  23.79 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  21.96 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  20.75 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  24.88 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.04 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  23.79 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  22.96 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  23.77 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  23.04 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  23.74 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  24.62 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  23.93 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  22.06 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.53 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  23.53 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.64 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.66 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  25.6 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  23.41 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  23.79 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  23.79 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.56 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  22.45 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  22.45 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  22.45 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  22.43 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  21.7 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.49 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.56 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  21.7 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  22.22 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  24.2 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  21.78 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  20.93 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  23.3 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  22.45 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  22.73 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  22.05 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  23.67 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  22.81 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  22.73 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  22.45 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  22.96 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  26.64 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.64 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  22.17 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  23.12 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  21.88 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  22.05 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  21.54 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.12 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.12 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  20.39 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  22.82 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.74 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.41 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.18 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  22.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  21.72 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.17 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  21.84 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.32 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.04 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.43 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  26.83 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>