69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1273 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  163  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  40.79 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  41.56 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  43.94 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  43.24 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  39.74 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  39.74 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  42.42 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  41.89 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  36.99 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  37.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  40.26 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  37.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  37.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  37.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  38.16 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.06 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  40.91 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  37.18 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  32.91 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  38.03 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  37.33 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  38.03 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  37.68 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  36.62 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  38.36 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  38.36 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  35.9 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  36.92 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  34.67 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  35.21 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  37.14 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  33.77 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  39.39 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  35.29 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  36.23 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  34.85 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  36.11 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  31.34 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  31.94 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  28.36 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  34.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  30.26 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  34.29 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  31.94 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  31.34 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  31.34 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  29.85 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  31.08 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  29.73 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>