29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0959 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  36.41 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0911  hypothetical protein  38.38 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  22.47 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  19.6 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  25.7 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  24.09 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  23.12 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  28.37 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  24.57 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2635  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.5 
 
 		 682 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  20 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6005  polysaccharide biosynthesis protein CapD  29.9 
 
 		 655 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6495  polysaccharide biosynthesis protein CapD  30.93 
 
 		 646 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08591  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  28.79 
 
 		 626 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1939  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.93 
 
 		 664 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 336 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2793  redox-sensing transcriptional repressor Rex  25.97 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2497  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.82 
 
 		 613 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.495773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  32.14 
 
 		 651 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.17 
 
 		 668 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  41.38 
 
 		 622 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  33.87 
 
 		 647 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.999244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 139 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1306  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase, membrane associated  38.03 
 
 		 635 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.238436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 622 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1651  polysaccharide biosynthesis protein CapD  31.87 
 
 		 637 aa  41.6  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449332  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>