27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2889 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  69.63 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  64.43 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  64.95 
 
 		 203 aa  254  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  64.21 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  39.27 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  28.33 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 119 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  41.46 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  38.82 
 
 		 126 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0911  hypothetical protein  27.96 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 167 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 77 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  33.33 
 
 		 690 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>