30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0625 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  63.18 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  64.4 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  63.87 
 
 		 203 aa  258  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  64.21 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  42.78 
 
 		 205 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  32.4 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 167 aa  62  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 105 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  32 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  46.15 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  32.29 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 106 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  25.28 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  35.63 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  26.34 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0911  hypothetical protein  25.97 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  37.66 
 
 		 690 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  37.35 
 
 		 691 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 77 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1706  hypothetical protein  30.69 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0763417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1277  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>