28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3791 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  72.22 
 
 		 201 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  72.08 
 
 		 203 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  69.63 
 
 		 202 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  63.18 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  43.08 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  37.76 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  31.4 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  50.72 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  50.72 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  39.39 
 
 		 126 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0959  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1405  hypothetical protein  26.4 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1706  hypothetical protein  29.29 
 
 		 142 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0763417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  39.29 
 
 		 622 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>