More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0011 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  69.73 
 
 
185 aa  276  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  69.73 
 
 
185 aa  276  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0845  elongation factor P  67.03 
 
 
185 aa  265  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0094  elongation factor P  65.41 
 
 
185 aa  261  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  48.11 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  48.11 
 
 
187 aa  174  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  47.03 
 
 
185 aa  174  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  47.83 
 
 
185 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  45.11 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  47.83 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  45.41 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  45.95 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  44.32 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  44.32 
 
 
185 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  45.95 
 
 
185 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.02 
 
 
188 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  43.78 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  45.41 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  44.02 
 
 
185 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  42.7 
 
 
187 aa  161  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  43.78 
 
 
185 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  42.7 
 
 
185 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  42.16 
 
 
187 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  42.39 
 
 
185 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  42.39 
 
 
185 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  44.86 
 
 
184 aa  157  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  42.16 
 
 
185 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.08 
 
 
185 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  41.85 
 
 
187 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.46 
 
 
185 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  42.08 
 
 
190 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  41.85 
 
 
187 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  41.3 
 
 
186 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4726  translation elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0198786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  42.39 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  41.85 
 
 
185 aa  151  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  42.47 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  42.93 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  42.16 
 
 
185 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2026  translation elongation factor P  42.16 
 
 
184 aa  150  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0568495  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  41.3 
 
 
186 aa  150  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  43.78 
 
 
187 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  39.67 
 
 
187 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1204  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0186048  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  39.34 
 
 
194 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  39.01 
 
 
188 aa  148  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  39.34 
 
 
190 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  42.7 
 
 
185 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  39.34 
 
 
190 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  40.76 
 
 
185 aa  148  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  39.34 
 
 
190 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  38.8 
 
 
190 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  40.22 
 
 
187 aa  147  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  40.32 
 
 
186 aa  147  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  38.46 
 
 
187 aa  147  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0908  elongation factor P  39.34 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  40.78 
 
 
211 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1673  elongation factor P  39.78 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0528858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  42.58 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  40.76 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  40 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40.54 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  39.11 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  36.26 
 
 
189 aa  145  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  42.39 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  40.22 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  38.8 
 
 
190 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  38.59 
 
 
188 aa  144  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  38.46 
 
 
189 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  42.58 
 
 
189 aa  144  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  40.54 
 
 
186 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  42.17 
 
 
216 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  38.46 
 
 
189 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  39.67 
 
 
186 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  38.46 
 
 
189 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>