More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1039 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  42.9 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  40.61 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  39.19 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  37.63 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  39.86 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  37.23 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  37.05 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  37.29 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  39.86 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  35.67 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  35.07 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  35.15 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  35.56 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  35.56 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  35.21 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  33.78 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  34.74 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  38.03 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.29 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.64 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  40.07 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  33.45 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  36.08 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  34.26 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  36.11 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  37.88 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  35.93 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  33.57 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  36.61 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  35.25 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  36.55 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  36.08 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  37.29 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  35.59 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.22 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  33.1 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  33.57 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.58 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  32.2 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  28.52 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  33.68 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  33.9 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  34.58 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  34.56 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  34.24 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  35.79 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  34.01 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  34.86 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  34.93 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  33.58 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  33.68 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  32.29 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  35.92 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  35.92 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  34.51 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  30.21 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  33.79 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.55 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  35 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  32.29 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.45 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  30.21 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  33.23 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  33.77 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  33.79 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.45 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  34.17 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  34.15 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  34.15 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.07 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  29.79 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.98 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>