55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0840 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1256    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  50.86 
 
 
454 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  48.43 
 
 
636 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  45.71 
 
 
755 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.7 
 
 
679 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.93 
 
 
559 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  59.77 
 
 
186 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  29.43 
 
 
583 aa  220  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  29.44 
 
 
844 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  31.72 
 
 
847 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  32.08 
 
 
843 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  30.05 
 
 
844 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 
559 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  31.52 
 
 
792 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  34.23 
 
 
436 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.54 
 
 
668 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  34.56 
 
 
564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  31.85 
 
 
371 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.08 
 
 
796 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.57 
 
 
578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  32.08 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.97 
 
 
751 aa  114  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.02 
 
 
914 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  27.93 
 
 
671 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  26.82 
 
 
735 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  26.64 
 
 
712 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  29.94 
 
 
549 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.31 
 
 
568 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.69 
 
 
542 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.95 
 
 
663 aa  99  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  24.86 
 
 
880 aa  80.9  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  31.48 
 
 
716 aa  77.4  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  30.69 
 
 
778 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  27.69 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  26.67 
 
 
431 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  26.67 
 
 
418 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  26.67 
 
 
418 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  27.59 
 
 
606 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  27.36 
 
 
606 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  27.36 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  27.36 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  27.36 
 
 
606 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  27.64 
 
 
606 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  27.36 
 
 
609 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  28.06 
 
 
605 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  28.43 
 
 
605 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  27.98 
 
 
605 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  26.04 
 
 
605 aa  57.4  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  28.05 
 
 
205 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  41.54 
 
 
201 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  39.73 
 
 
197 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  28.95 
 
 
197 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>