45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3464 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  49.01 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  48.34 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  44.3 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  44.3 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  43.75 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  44.44 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  45.57 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  42.96 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  57.29 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  42.47 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  45.63 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  49.51 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  51.43 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  45.33 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  44.23 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  46.3 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  41.67 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  49.4 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  41.13 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  37.86 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  40.54 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  36.89 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  34.95 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  32.14 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  33.64 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  32.32 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  31.39 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  35 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  41.11 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  32.18 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  34.09 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1962  hypothetical protein  43.86 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  34.33 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  31.51 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  27.96 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>