More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1252 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 400 aa  812    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  52.36 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  52.49 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.75 
 
 		 646 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.35 
 
 		 650 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  49.51 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  49.14 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  49.14 
 
 		 399 aa  362  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  48.02 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 		 400 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 400 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.28 
 
 		 402 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  47.9 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.52 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 		 389 aa  359  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  47.77 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.52 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  46.65 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  48.3 
 
 		 403 aa  358  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.28 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  46.29 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  47.88 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.27 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  48.65 
 
 		 399 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  47.88 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.28 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.28 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  46.77 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  49.01 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  48.27 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  46.78 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  46.02 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  49.02 
 
 		 400 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  46.78 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.28 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 		 396 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  47.57 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4529  Phosphoglycerate kinase  48.98 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0899746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  47.8 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  47.67 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  47.06 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.37 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  47.74 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  49.01 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  45.64 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  47.06 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  46.93 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.91 
 
 		 655 aa  345  6e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  45.89 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  48.53 
 
 		 400 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  47.68 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  46.4 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  45.93 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  44.7 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  44.19 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  45.72 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  45.79 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  45.71 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  45.77 
 
 		 395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  45.83 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  45.23 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1766  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  45.43 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  45.56 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  44.36 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  45.72 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  46.46 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1401  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  46.81 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2229  phosphoglycerate kinase  45.61 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  45.1 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  45.15 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>