More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0200 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.85 
 
 
241 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.76 
 
 
243 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.69 
 
 
273 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.05 
 
 
264 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.57 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.04 
 
 
255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.87 
 
 
187 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  47.25 
 
 
224 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.51 
 
 
253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.7 
 
 
235 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.14 
 
 
210 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.7 
 
 
209 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.77 
 
 
264 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.11 
 
 
271 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  45.14 
 
 
233 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.25 
 
 
295 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.25 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.07 
 
 
380 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.41 
 
 
433 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.9 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.25 
 
 
231 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.67 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.69 
 
 
245 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.59 
 
 
295 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.31 
 
 
203 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.09 
 
 
207 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.57 
 
 
294 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.25 
 
 
264 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  47.95 
 
 
213 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.53 
 
 
199 aa  169  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.95 
 
 
285 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.55 
 
 
300 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.99 
 
 
294 aa  168  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  44.44 
 
 
264 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.78 
 
 
209 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
264 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.24 
 
 
358 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.7 
 
 
317 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.35 
 
 
276 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.09 
 
 
185 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  46.7 
 
 
292 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 
455 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 
455 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.2 
 
 
455 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.09 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 
455 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.2 
 
 
455 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.14 
 
 
301 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.2 
 
 
468 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.05 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.11 
 
 
309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.05 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.2 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  44.02 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.66 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.66 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.09 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  46.07 
 
 
260 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.68 
 
 
414 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  46.02 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.02 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.14 
 
 
346 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.1 
 
 
202 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.14 
 
 
346 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.14 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.26 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.32 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.28 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.37 
 
 
238 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.3 
 
 
186 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.71 
 
 
208 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.98 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.7 
 
 
196 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.18 
 
 
277 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.2 
 
 
401 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5420  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.62 
 
 
300 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.06 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.02 
 
 
290 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.77 
 
 
220 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.57 
 
 
217 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.89 
 
 
235 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.19 
 
 
277 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  46.96 
 
 
255 aa  159  6e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
341 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.63 
 
 
227 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.15 
 
 
205 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.38 
 
 
281 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.81 
 
 
192 aa  156  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.44 
 
 
190 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.88 
 
 
216 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.82 
 
 
223 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.19 
 
 
263 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.81 
 
 
290 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.43 
 
 
327 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  46.33 
 
 
226 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.55 
 
 
200 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.68 
 
 
264 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.33 
 
 
191 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>