56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3540 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  75.36 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  71.03 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  74.05 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  67.63 
 
 		 149 aa  191  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  70.8 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  72.46 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  77.21 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  68.12 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  67.39 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  68.15 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  64.34 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  63.64 
 
 		 139 aa  169  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  59.38 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  57.14 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  62.88 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  48.15 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  48.55 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  53.23 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  46.04 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  48.06 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  48.85 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  46.81 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  42.36 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  49.24 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  41.3 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  40.74 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  40.91 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  40.91 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  45.04 
 
 		 154 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  42.03 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  37.88 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  39.84 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  38.71 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  40.62 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  30.34 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  27.41 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.95 
 
 		 461 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  23.91 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>