More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0022 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
360 aa  743    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  78.33 
 
 
364 aa  599  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0858  radical SAM domain-containing protein  63.2 
 
 
338 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  41.08 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
338 aa  250  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 
364 aa  245  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0539  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 
376 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00688869  normal  0.395603 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 
331 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  38.65 
 
 
331 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2551  pyruvate formate-lyase activating enzyme-like protein  39.65 
 
 
354 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592966  normal  0.73651 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 
363 aa  238  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  40.18 
 
 
336 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1470  radical SAM domain-containing protein  41.72 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.808287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0779  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
336 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0540  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 
337 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 
342 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  39.09 
 
 
384 aa  230  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1055  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 
335 aa  227  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.146783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  38.56 
 
 
333 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 
334 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 
351 aa  225  8e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 
336 aa  225  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  38.97 
 
 
353 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 
337 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 
336 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
336 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1761  Radical SAM domain protein  39.51 
 
 
337 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0383887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  38.65 
 
 
337 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  38.84 
 
 
335 aa  222  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 
351 aa  222  9e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  37.39 
 
 
336 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1698  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0761  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 
340 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00535967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  39.21 
 
 
337 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 
405 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  35.49 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  38.17 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.05 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0629  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000217214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1841  Radical SAM domain protein  37.81 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 
333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1670  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 
362 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0537367  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 
343 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0217  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
356 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  35 
 
 
335 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2243  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 
337 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0086  radical SAM family protein  39.24 
 
 
356 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  37.46 
 
 
332 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 
337 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  35.84 
 
 
333 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0464  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 
348 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.521225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 
356 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2213  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 
367 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0093  Radical SAM domain protein  39.31 
 
 
356 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 
339 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0388  Radical SAM domain protein  33.54 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00103201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1123  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 
345 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1314  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 
345 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1325  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
365 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.322233  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.53 
 
 
336 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  37.28 
 
 
364 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0917  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 
324 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  35.69 
 
 
361 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 
361 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1849  radical SAM family protein  34.59 
 
 
329 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2948  radical SAM family Fe-S protein  35.4 
 
 
347 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2430  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 
365 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0451112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 
286 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0088  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 
357 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.400989  normal  0.227798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2539  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 
360 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1095  radical SAM domain protein  32.94 
 
 
345 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 
314 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 
395 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1870  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  34.52 
 
 
358 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 
348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1005  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 
370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 
282 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0200  Radical SAM domain protein  35.41 
 
 
386 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6076  radical SAM family protein  35.29 
 
 
363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3292  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 
366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 
374 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2136  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.219183  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1969  radical SAM family protein  35.76 
 
 
370 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5878  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
362 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206709  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2684  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 
367 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  35.89 
 
 
294 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0449  radical SAM family protein  35.33 
 
 
370 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0893  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.910266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>