45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5472 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5472  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  943    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5471  hypothetical protein  56.98 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2516  hypothetical protein  51.27 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0604  hypothetical protein  42.07 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243924  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1315  hypothetical protein  29.91 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.297813  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0631  hypothetical protein  28.02 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.831891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0899  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3949  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0638  TPR domain-containing protein  28.31 
 
 		 459 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.044891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0936  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 466 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  normal  0.106042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0885  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000189506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0332171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1061  TPR domain-containing protein  26.5 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3038  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000055247  normal  0.645895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3014  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00235052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3477  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0100527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3600  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000996774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3242  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0825  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.692927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2913  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000006025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0915  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0669152  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0598  putative lipoprotein  24.67 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0837  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0965  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01520  hypothetical protein  23.67 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004002  putative lipoprotein  23.18 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1486  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00338852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1193  hypothetical protein  23.78 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.01113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1296  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 465 aa  97.1  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0179  conserved hypothetical lipoprotein  22.7 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2263  hypothetical protein  24.7 
 
 		 435 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.156064  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0064  hypothetical protein  24.9 
 
 		 477 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3852  hypothetical protein  23.41 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2794  sporulation domain-containing protein  27.21 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1831  tetratricopeptide TPR_4  23.53 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0190  hypothetical protein  22.9 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1811  hypothetical protein  23.29 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1905  hypothetical protein  21.18 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1890  hypothetical protein  23.29 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2066  hypothetical protein  23.15 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1668  hypothetical protein  23.3 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0084  putative lipoprotein  23.52 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0082  hypothetical protein  23.57 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0124  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2334  hypothetical protein  20.3 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000614425  normal  0.684774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>