More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3900 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  100 
 
 		 251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  70.04 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  67.21 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  67.77 
 
 		 271 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  62.88 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  56.25 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  59.62 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  57.6 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  53.66 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  48 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  53.25 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  52.48 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  53.16 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  50 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  47.56 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  53.66 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  48.77 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  49.58 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  45.38 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  46.8 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  53.88 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  51.65 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  50.43 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  53.73 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  53.73 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  48.75 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  53.73 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  53.73 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  53.27 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  47.76 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  47.76 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  46.85 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  47.35 
 
 		 331 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  46.94 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  46.94 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  48.35 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  46.64 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  49.12 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  51.78 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  53.3 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  51.78 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  48.13 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  47.56 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  43.39 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  46 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  44.86 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  45.2 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  47.95 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  45.2 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  44.35 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  49.75 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  44.13 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  47.83 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  42.15 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  46.5 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  51.41 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  42.68 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  47.75 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  47.77 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  40.5 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  48.36 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  47.3 
 
 		 261 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  44.59 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  47.13 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  47.13 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  41.33 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  40.89 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  40.89 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  41.78 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  40.89 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  40.89 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  41.33 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  44.44 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  46.43 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  45.5 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  43.67 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  43.95 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  42.31 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  53.4 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  42.31 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  48.4 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  43.05 
 
 		 263 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  45.36 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  40 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  46 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  36.29 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  37.05 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  37.05 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  37.05 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  36.65 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  41.13 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  38.67 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1817  class II aldolase/adducin family protein  35.74 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  40.72 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  35.96 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>