45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3628 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  48.12 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  49.32 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  48.8 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  49.83 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.29 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  44.37 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  44.37 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  44.75 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  36.27 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  37.38 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  46.73 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  38.89 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  37.88 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  36.95 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  32.99 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  34.15 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  31.48 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  31.34 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  30.99 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  32.61 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  31.69 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  37.12 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  30.85 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  28.93 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  30.48 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  28 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  30.8 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  31.72 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.77 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  31.89 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  34.16 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  30.17 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  27.95 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.46 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.13 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>