46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1717 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  60.7 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  34.32 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  34.58 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  36.58 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  34.33 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  35.31 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  33.33 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  36.17 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  32.89 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  34.9 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  32.2 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  32.44 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  33.89 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  34.23 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  35.74 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  31.53 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  35.25 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  31.53 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  34.77 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  34.77 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  32.86 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  30.85 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  31.15 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  31.99 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  34.94 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  32.35 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  31.76 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  33.22 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  33.11 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  32.67 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  28.53 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  32.44 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.3 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  31.19 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  29.41 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  29.47 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>