42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3672 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  76.47 
 
 		 290 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  73.79 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.14 
 
 		 290 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  72.76 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  73.1 
 
 		 290 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  72.07 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  71.03 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  73.1 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  72.07 
 
 		 290 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  72.07 
 
 		 290 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  73.61 
 
 		 291 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  71.63 
 
 		 291 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  64.36 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  65.74 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  61.81 
 
 		 310 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  52.6 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  52.78 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  50.69 
 
 		 295 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  41.75 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  40.4 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  32.99 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  34.11 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  35.96 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  35.93 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  32.89 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  32.23 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  32.28 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  29.59 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  27.65 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  30.85 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  27.43 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  28.15 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  27.84 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  27.56 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  27.52 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>