44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3730 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  97.93 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  97.24 
 
 		 290 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  96.55 
 
 		 290 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  82.76 
 
 		 290 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  82.76 
 
 		 290 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  82.76 
 
 		 290 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  82.07 
 
 		 290 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  73.36 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  74.48 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  74.65 
 
 		 291 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  72.76 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  69.79 
 
 		 291 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  67.59 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  62.82 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  64.71 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  54.17 
 
 		 291 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  52.08 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  51.74 
 
 		 295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  39.06 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  39.39 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  34.46 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  36.39 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  31.53 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  31.53 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.99 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  31.1 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  32.89 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  33.56 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  32.43 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  29.47 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  29.67 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  31.34 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  30.24 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  28.33 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.93 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  28.17 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  31.4 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  27.18 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  26.34 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.34 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>