49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2560 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  67.24 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  68.28 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  67.24 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.9 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  67.59 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  68.97 
 
 		 290 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  68.97 
 
 		 290 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  66.78 
 
 		 290 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  65.05 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  68.97 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  67.36 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  64.08 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  65.74 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  65.28 
 
 		 291 aa  352  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  60.76 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  54.17 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  50.35 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  38.72 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  37.71 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  34.38 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  36.93 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  32.46 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  32.2 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  32.67 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.65 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  32.62 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  30.2 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  34.07 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  28.72 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  31.1 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  29.69 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  32.86 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.31 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  29.27 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  30.82 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  26.89 
 
 		 288 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  26.05 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  30.95 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  25.21 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  25.11 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  25.21 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  25.21 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>