44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00853 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  54.17 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  54.67 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  53.47 
 
 		 290 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  53.82 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  53.82 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  54.51 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.12 
 
 		 290 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  51.38 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  52.43 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  52.43 
 
 		 290 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  52.43 
 
 		 290 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  53.45 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  52.41 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  52.6 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  48.7 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  50.35 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  47.04 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  47.4 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  36.81 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  34.81 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  36.71 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  30.67 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  30.24 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  30.24 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  30.74 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  32.27 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  29.63 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  29.97 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  32.76 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  27.54 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  31.56 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  29.79 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  31.21 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  28.28 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  29.51 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  25.66 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  29.03 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>