43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0888 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  65.28 
 
 		 290 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  65.05 
 
 		 290 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  64.36 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  64.83 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  64.71 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  63.89 
 
 		 290 aa  363  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.67 
 
 		 290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  65.4 
 
 		 290 aa  361  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  65.4 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  65.4 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  64.36 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  63.1 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  62.07 
 
 		 291 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  60.76 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  54.02 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  52.26 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  51.38 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  49.83 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  37.79 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  35.84 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  35.92 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  34.97 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  31.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  29.79 
 
 		 307 aa  118  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.77 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  30.61 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  30.61 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  32.18 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  31.1 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  31.69 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  28.28 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  27.4 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  30.3 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  28.28 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  29.03 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  25.34 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>