42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3448 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  78.89 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.09 
 
 		 290 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  74.39 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  74.05 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  73.36 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  74.05 
 
 		 290 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  76.47 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  73.7 
 
 		 290 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  73.36 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  73.36 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  73.01 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  68.06 
 
 		 310 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  70.83 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  65.28 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  66.78 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  54.51 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  54.51 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  53.12 
 
 		 295 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  41.89 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  32.29 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  34.59 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  35.35 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  36.58 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  32.44 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  29.83 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  29.83 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  31.76 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  31.1 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  30.53 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  28.24 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  32.41 
 
 		 312 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  30.85 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  31.4 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  28 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  31.01 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  31.45 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  30.99 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  30.74 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  25.97 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>