43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5288 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  74.76 
 
 		 311 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  74.76 
 
 		 311 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  49.37 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  37.87 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  44.75 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  40 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  35.74 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  35.5 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  40.32 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.08 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  35.08 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  36.33 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  37.87 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  38.54 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  36.05 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  33.66 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  31.1 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  29.28 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  29.63 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  27.52 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  28.86 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  30.88 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  30 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  27.39 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  28.24 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  30.54 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  32.68 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  29.19 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  27.34 
 
 		 291 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  30 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  31.91 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  32.53 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  26.81 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.75 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>