45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3251 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3251  DMT superfamily permease  100 
 
 		 313 aa  587  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0475  hypothetical protein  44.12 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0516  hypothetical protein  44.98 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7599  hypothetical protein  45.95 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0081  DMT family permease  46.58 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0606  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.28 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3628  hypothetical protein  46.73 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0102  hypothetical protein  45.93 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0798  multidrug ABC transporter permease  37.66 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5288  hypothetical protein  40.95 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3297  hypothetical protein  38.31 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2650  hypothetical protein  38.31 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0830  hypothetical protein  35.95 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0072  hypothetical protein  35.9 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2824  hypothetical protein  35.28 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3138  hypothetical protein  32.57 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.934061  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2181  hypothetical protein  32.56 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0483512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2847  membrane protein  29.74 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0888  membrane protein  29.47 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.704512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1546  ribosomal protein L35  29.07 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2560  hypothetical protein  30.72 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3838  drug/metabolite exporter family protein  30.23 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0125925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3822  hypothetical protein  28.1 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0776  hypothetical protein  29.19 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3162  hypothetical protein  28.76 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0804  hypothetical protein  28.76 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0729  hypothetical protein  29.17 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3607  hypothetical protein  27.09 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3119  hypothetical protein  25.94 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00853  hypothetical protein  30.16 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3730  hypothetical protein  27.18 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0704  hypothetical protein  26.85 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1717  hypothetical protein  30.39 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3448  hypothetical protein  25.97 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3539  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.826878  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0550  hypothetical protein  31.08 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2655  ribosomal protein L35  26.21 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3672  hypothetical protein  27.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.952229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2903  hypothetical protein  27.93 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.91197  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.212959  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  26.53 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>