More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2039 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 308 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  85.71 
 
 		 308 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  85.39 
 
 		 308 aa  553  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  84.69 
 
 		 328 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  80.84 
 
 		 308 aa  524  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  78.9 
 
 		 308 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  70.92 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  59.41 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  59.21 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  58.55 
 
 		 309 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  58.36 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  57.89 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  57.89 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  58.55 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  58.22 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  59.21 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 305 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 319 aa  354  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  55.56 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  55.26 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  55.23 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 310 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  54.43 
 
 		 310 aa  345  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  58.09 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  51.47 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  54.28 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  44.98 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  53.41 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  50.38 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.83 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.98 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.96 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 355 aa  281  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  44.9 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  50.74 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  44.67 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  47.04 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 		 305 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  51.12 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  50.75 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  50.75 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  50.75 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  46.53 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  45.6 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  50.19 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.67 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50.19 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 		 301 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.56 
 
 		 316 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  50.37 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.28 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.71 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  48.11 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>