More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0545 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  79.87 
 
 		 447 aa  711    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  80.31 
 
 		 447 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  73.77 
 
 		 447 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  74.32 
 
 		 447 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  80.31 
 
 		 447 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 447 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  73.84 
 
 		 447 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  64.88 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  63.76 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  62.36 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.86 
 
 		 452 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  61.54 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  62.58 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  60.9 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  60.9 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  61.35 
 
 		 459 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  63.51 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  60.85 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  60.45 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 		 451 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  63.74 
 
 		 456 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  59.33 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  60.45 
 
 		 449 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  60 
 
 		 448 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  58.65 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  62.88 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  60 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  62.38 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  61.74 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  62.38 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  62.09 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  59.55 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  60.85 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  57.74 
 
 		 449 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  58.88 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 		 450 aa  511  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  59.35 
 
 		 450 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  56.92 
 
 		 451 aa  508  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  57.37 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  55.61 
 
 		 454 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  55.16 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  55.58 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  54.24 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  52.91 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  53.03 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  55.31 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  55.31 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  54.46 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  54.41 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  54.94 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  54.92 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  54.17 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  52.1 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  51.69 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  52.61 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  51.13 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 445 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  51.21 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 		 453 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  51.81 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 		 445 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  50.99 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 		 452 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 		 452 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>