27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0081 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 589 aa  1204    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 545 aa  87.8  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  35.17 
 
 		 568 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  24.39 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 294 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  33.06 
 
 		 128 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 188 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.07 
 
 		 266 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 310 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 130 aa  47.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  37.68 
 
 		 380 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  29.63 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  40 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 360 aa  45.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 370 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 213 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 213 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 379 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 367 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>