More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1066 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  35.32 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.98 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  34 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  33.46 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.6 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.85 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.56 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.72 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.72 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.72 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35.89 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.82 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.82 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.5 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.82 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.05 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.27 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.13 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.05 
 
 		 250 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.13 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  33.76 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.13 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.13 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.13 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  35.41 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  30.59 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  34.2 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  31.89 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.96 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.48 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.65 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.48 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.64 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.48 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.05 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.05 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.05 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.05 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.62 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.99 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.07 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 207 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.1 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.07 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  29.38 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  28.35 
 
 		 212 aa  92.4  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  30 
 
 		 187 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 173 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.01 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  45.36 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.87 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.39 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.94 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.66 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.92 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  26.05 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  37.86 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.25 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  30.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  29.3 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.79 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>