More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0100 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 481 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  1006    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 485 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 		 487 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 493 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 		 494 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 480 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 480 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 485 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 485 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 485 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 465 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 490 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 460 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 459 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 461 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  50.4 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 459 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 459 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 460 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 459 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 461 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 482 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 460 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 487 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  47.96 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>