173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0356 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0356  redoxin  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  68.15 
 
 		 157 aa  230  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  61.15 
 
 		 157 aa  206  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  61.15 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  60.51 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  59.24 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  60.76 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  61.15 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.51 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  61.39 
 
 		 178 aa  197  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  59.87 
 
 		 157 aa  196  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  59.49 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  59.49 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  59.49 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  58.23 
 
 		 157 aa  190  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  59.24 
 
 		 157 aa  189  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  57.96 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  60.38 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  55.06 
 
 		 251 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  57.5 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  53.89 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  58.28 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  53.89 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  57.14 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  52.69 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  58.54 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  53.89 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  55.06 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.35 
 
 		 167 aa  167  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.76 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  54.43 
 
 		 243 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  54.43 
 
 		 243 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  52.53 
 
 		 249 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  56.1 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  53.29 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  54.17 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  51.5 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.5 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.5 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.25 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.71 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  51.5 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  51.5 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  51.5 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  52.53 
 
 		 248 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  51.5 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  51.9 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  50.28 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.1 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  50.97 
 
 		 259 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  51.5 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  53.8 
 
 		 238 aa  161  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  51.5 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  51.27 
 
 		 242 aa  160  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  50 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 243 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  51.88 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  51.5 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  54.6 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  52.23 
 
 		 247 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  52.53 
 
 		 245 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.21 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  51.27 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  51.59 
 
 		 246 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  49.37 
 
 		 248 aa  157  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  50 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  49.37 
 
 		 248 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  51.3 
 
 		 243 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  52.2 
 
 		 160 aa  156  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  50.32 
 
 		 243 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  54.09 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  50.32 
 
 		 243 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  50.32 
 
 		 243 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  52.35 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  53.66 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  49.68 
 
 		 243 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  50 
 
 		 247 aa  154  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  50.32 
 
 		 247 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  50 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.6 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  45.95 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  51.27 
 
 		 243 aa  153  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  49.41 
 
 		 176 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.94 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  49.68 
 
 		 242 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.1 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  54.72 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  50.94 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>