162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04309 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  782  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  73.1 
 
 
394 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  72.59 
 
 
394 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  72.59 
 
 
394 aa  561  1e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  47.88 
 
 
393 aa  310  3e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  44.25 
 
 
386 aa  303  3e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  46.23 
 
 
403 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  44.68 
 
 
393 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  43.01 
 
 
394 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  42.93 
 
 
417 aa  285  7e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  42.93 
 
 
388 aa  284  2e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  44.47 
 
 
396 aa  283  3e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  48.94 
 
 
384 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  44.09 
 
 
394 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  44.21 
 
 
391 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  44.22 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  44.13 
 
 
386 aa  277  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  44.19 
 
 
396 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  44.47 
 
 
396 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  43.54 
 
 
396 aa  273  5e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  44.22 
 
 
396 aa  272  8e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  44.22 
 
 
396 aa  272  8e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  44.84 
 
 
396 aa  270  3e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  44.84 
 
 
410 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  44.84 
 
 
410 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  7.10511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  44.84 
 
 
396 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  44.84 
 
 
396 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  44.84 
 
 
396 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  44.84 
 
 
396 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  43.32 
 
 
410 aa  266  3e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  43.18 
 
 
397 aa  267  3e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  44.65 
 
 
398 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  44 
 
 
396 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  41.11 
 
 
424 aa  265  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  44 
 
 
397 aa  262  7e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  44.24 
 
 
375 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  44.71 
 
 
451 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  42.04 
 
 
397 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  41.99 
 
 
370 aa  255  9e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  41.06 
 
 
370 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  42.04 
 
 
397 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  41.51 
 
 
397 aa  246  5e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  36.22 
 
 
395 aa  240  3e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  36.22 
 
 
395 aa  236  5e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  39.36 
 
 
398 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  39.54 
 
 
400 aa  222  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  36.62 
 
 
375 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  38.98 
 
 
360 aa  201  1e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  38.35 
 
 
404 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  38.06 
 
 
358 aa  196  8e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  36.88 
 
 
394 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  35.14 
 
 
398 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  36.84 
 
 
369 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  35.71 
 
 
337 aa  181  3e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.74 
 
 
393 aa  180  5e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  37.64 
 
 
387 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  1.18713e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  33.7 
 
 
386 aa  175  1e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  7.52417e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  35.9 
 
 
368 aa  175  2e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  35.6 
 
 
366 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  36.13 
 
 
362 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.18 
 
 
384 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  36.07 
 
 
376 aa  167  3e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  32.2 
 
 
387 aa  163  4e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  35.85 
 
 
370 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.45 
 
 
410 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  32.79 
 
 
385 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  32.49 
 
 
385 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  32.6 
 
 
404 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.84 
 
 
384 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  32.45 
 
 
386 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.7 
 
 
386 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.69 
 
 
397 aa  148  1e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.4 
 
 
377 aa  148  1e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  28.05 
 
 
370 aa  148  1e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.19 
 
 
385 aa  148  1e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.78 
 
 
377 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  27.76 
 
 
370 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.77 
 
 
394 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.46 
 
 
378 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  29.17 
 
 
370 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  29.47 
 
 
368 aa  141  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  29.52 
 
 
370 aa  141  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  28.53 
 
 
396 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  27.68 
 
 
396 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  27.12 
 
 
370 aa  136  6e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  27.12 
 
 
370 aa  136  7e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  27.12 
 
 
368 aa  136  7e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  27.12 
 
 
370 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  26.84 
 
 
370 aa  134  2e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.08 
 
 
396 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  26.8 
 
 
396 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  27.09 
 
 
370 aa  132  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  27.37 
 
 
380 aa  129  7e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  31.44 
 
 
340 aa  126  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  29.14 
 
 
392 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  31.89 
 
 
405 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  26.12 
 
 
400 aa  122  1e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  31.43 
 
 
377 aa  122  1e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  25.86 
 
 
400 aa  120  5e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  31.23 
 
 
363 aa  119  1e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>