84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3465 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  94.07 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  69.92 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  69.07 
 
 		 236 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  62.71 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  61.86 
 
 		 288 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  61.02 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  61.02 
 
 		 236 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  61.02 
 
 		 236 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  61.02 
 
 		 236 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  60.43 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  38.08 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  41 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  37.45 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  32.44 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  32.63 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  29.43 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.75 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  23.63 
 
 		 447 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.67 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  28.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  28.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  28.88 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  38.81 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  28.34 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.15 
 
 		 203 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 236 aa  42  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>