44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2807 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  601  1e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  60.42 
 
 
292 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  58.87 
 
 
292 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  58.87 
 
 
292 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.17 
 
 
302 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.3 
 
 
287 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.04 
 
 
315 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 
320 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  35.07 
 
 
289 aa  135  7e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.6 
 
 
285 aa  129  4e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.96 
 
 
291 aa  129  5e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.82 
 
 
288 aa  128  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.68 
 
 
292 aa  127  2e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.95 
 
 
291 aa  125  8e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.06 
 
 
298 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.2 
 
 
269 aa  120  2e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.88 
 
 
282 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 
285 aa  113  4e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 
284 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  36.08 
 
 
291 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  29.03 
 
 
416 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  33.96 
 
 
304 aa  77.4  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.76 
 
 
265 aa  75.1  1e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  23.53 
 
 
298 aa  71.6  1e-11  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  30.7 
 
 
273 aa  63.2  6e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  27.89 
 
 
270 aa  61.2  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 
267 aa  59.7  6e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  30.46 
 
 
271 aa  57.8  2e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.8 
 
 
259 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 
146 aa  51.6  1e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.39 
 
 
274 aa  52.4  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 
314 aa  51.2  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 
314 aa  50.8  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  50.8  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05023  hypothetical protein  33.94 
 
 
160 aa  49.7  5e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.372141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.29 
 
 
271 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  36.84 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.66 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  29.7 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  24.14 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.22866e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.88 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.5 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>