205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2579 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  57.29 
 
 		 577 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  57.29 
 
 		 577 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1197    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  57.98 
 
 		 577 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  58.5 
 
 		 583 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  56.65 
 
 		 573 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  57.98 
 
 		 577 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  57.98 
 
 		 577 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  71.38 
 
 		 600 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  56.94 
 
 		 577 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  94.15 
 
 		 592 aa  1112    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  56.5 
 
 		 589 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  97.26 
 
 		 584 aa  1140    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  57.8 
 
 		 577 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  71.21 
 
 		 600 aa  829    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  57.98 
 
 		 577 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  57.29 
 
 		 577 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  57.12 
 
 		 577 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  55.56 
 
 		 565 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  30.48 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  29.75 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.68 
 
 		 571 aa  176  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  30.84 
 
 		 575 aa  147  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 560 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  29.91 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  25.2 
 
 		 553 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  28.5 
 
 		 614 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  24.19 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  27.73 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  23.67 
 
 		 550 aa  118  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  24.53 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  24.53 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  25 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  26.46 
 
 		 551 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  26.8 
 
 		 552 aa  113  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  25.54 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  23.79 
 
 		 549 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  25.99 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  25.99 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  25.99 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  25.99 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  26.75 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  25.1 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.71 
 
 		 549 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  25.05 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  24.55 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  24.55 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  24.55 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  24.55 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  24.55 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  24.55 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  25.26 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  24.87 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  24.63 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  24.6 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  24.52 
 
 		 531 aa  104  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  24.65 
 
 		 547 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  24.65 
 
 		 547 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  28.52 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  24.69 
 
 		 505 aa  104  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  28.32 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  23.54 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  28.78 
 
 		 563 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  27.97 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  24.87 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  27.1 
 
 		 555 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  25.69 
 
 		 545 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  25.16 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  23.76 
 
 		 515 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  22.79 
 
 		 580 aa  98.6  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  26.82 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  23.3 
 
 		 545 aa  97.8  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  23.22 
 
 		 576 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  21.66 
 
 		 539 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  26.74 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  23.44 
 
 		 547 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  23.51 
 
 		 552 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  23.5 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  22.7 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  26.9 
 
 		 549 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  24.6 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  24.53 
 
 		 544 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4207  phosphoethanolamine transferase  25.95 
 
 		 560 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  25 
 
 		 547 aa  93.6  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0178  phosphoethanolamine transferase  26.26 
 
 		 563 aa  94  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>