200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4523 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  88.73 
 
 
577 aa  1085    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  89.08 
 
 
577 aa  1088    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  57.8 
 
 
584 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  57.98 
 
 
592 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  77.56 
 
 
573 aa  931    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  60.15 
 
 
600 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  99.83 
 
 
577 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  89.25 
 
 
577 aa  1089    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  57.62 
 
 
584 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  99.65 
 
 
577 aa  1187    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  59.96 
 
 
600 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  100 
 
 
577 aa  1191    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  99.83 
 
 
577 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  99.83 
 
 
577 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  89.43 
 
 
577 aa  1090    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  54.46 
 
 
589 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  53.82 
 
 
583 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  52.32 
 
 
565 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  28.23 
 
 
553 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  27.63 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  25.87 
 
 
571 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  28.22 
 
 
592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  25.05 
 
 
553 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  27.96 
 
 
614 aa  130  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  29.05 
 
 
551 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 
560 aa  120  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  25.19 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  28.21 
 
 
575 aa  114  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  27.54 
 
 
552 aa  114  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  24.66 
 
 
505 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  24.66 
 
 
541 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  24.66 
 
 
547 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  24.66 
 
 
541 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  24.27 
 
 
515 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  25.74 
 
 
505 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  24.66 
 
 
541 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  23.59 
 
 
589 aa  106  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  24.66 
 
 
541 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  24.66 
 
 
541 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  24.59 
 
 
544 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  24.78 
 
 
550 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  24.05 
 
 
512 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  24.8 
 
 
544 aa  97.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  26.91 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  24.8 
 
 
544 aa  96.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  24.84 
 
 
542 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4754  sulfatase family protein  26.02 
 
 
499 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  24.21 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  24.22 
 
 
545 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  24.07 
 
 
545 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0178  phosphoethanolamine transferase  23.81 
 
 
563 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11544  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  25.05 
 
 
531 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3047  lipid A phosphoethanolamine transferase  25 
 
 
506 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  22.63 
 
 
539 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  27.11 
 
 
567 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1859  phosphoethanolamine transferase  26.04 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  23.95 
 
 
543 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  26.06 
 
 
572 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  25.91 
 
 
544 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  23.99 
 
 
563 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4143  phosphoethanolamine transferase  25 
 
 
560 aa  87.4  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  25.16 
 
 
545 aa  87.4  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  24.57 
 
 
549 aa  87  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  23.78 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  23.78 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  23.78 
 
 
563 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0044  conserved hypothetical protein, putative sulfatase  22.93 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  24.26 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0080  phosphoethanolamine transferase  22.63 
 
 
563 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4081  phosphoethanolamine transferase  22.63 
 
 
563 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4133  phosphoethanolamine transferase  22.63 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.257424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.25 
 
 
555 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  23.21 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  23.21 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  24.8 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  23.22 
 
 
547 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  23.21 
 
 
563 aa  84.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  23.21 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  24.8 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  24.8 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  23.21 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  23.21 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  23.21 
 
 
563 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  24.8 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.2 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4207  phosphoethanolamine transferase  23.61 
 
 
560 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  23.16 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4490  phosphoethanolamine transferase  24.63 
 
 
559 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.950688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  23.52 
 
 
557 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0131  phosphoethanolamine transferase  25.94 
 
 
564 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.173638  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  23.16 
 
 
563 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4248  lipid A phosphoethanolamine transferase  25.19 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  23.05 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  25 
 
 
568 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  23.15 
 
 
545 aa  80.5  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>