34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1306 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  97.24 
 
 		 217 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  52.28 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  52.88 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  50.25 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  51.61 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  43 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  41.51 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  43.48 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  37.27 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  37.56 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 		 244 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  35.75 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  35.24 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  29.03 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  27.44 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  29.25 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  27.64 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  27.6 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.18 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  27.54 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  27.78 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  28.51 
 
 		 525 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  28.06 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  27.13 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.82 
 
 		 516 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.39 
 
 		 521 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  26.04 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  25.38 
 
 		 197 aa  42  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>