More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71553 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  46.82 
 
 		 4917 aa  2035    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  43.1 
 
 		 4844 aa  1700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  100 
 
 		 4979 aa  10210    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  37.32 
 
 		 1879 aa  1215    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40957  predicted protein  40.83 
 
 		 358 aa  227  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367798  normal  0.330846 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.06 
 
 		 855 aa  99.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  34.81 
 
 		 285 aa  91.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  28.36 
 
 		 263 aa  90.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  28.36 
 
 		 263 aa  90.5  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.78 
 
 		 263 aa  89.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  30.2 
 
 		 400 aa  90.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  31.02 
 
 		 285 aa  88.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  31.66 
 
 		 266 aa  88.2  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  32.1 
 
 		 315 aa  88.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  31.08 
 
 		 313 aa  85.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  32.54 
 
 		 279 aa  86.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  31.58 
 
 		 260 aa  85.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.32 
 
 		 272 aa  84.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  31.32 
 
 		 272 aa  84.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  33 
 
 		 267 aa  84  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  31.48 
 
 		 409 aa  84  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  30.77 
 
 		 265 aa  83.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.02 
 
 		 308 aa  84  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.49 
 
 		 286 aa  83.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.02 
 
 		 278 aa  83.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.9 
 
 		 286 aa  82.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  29.76 
 
 		 269 aa  82.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.73 
 
 		 290 aa  83.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  34.08 
 
 		 306 aa  82.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  30.41 
 
 		 270 aa  82.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  30.43 
 
 		 267 aa  82.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.07 
 
 		 266 aa  82  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  32.24 
 
 		 265 aa  82  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  32.24 
 
 		 265 aa  82  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  34.18 
 
 		 270 aa  82  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  31.43 
 
 		 280 aa  81.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  32.22 
 
 		 275 aa  80.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  30.84 
 
 		 260 aa  80.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.57 
 
 		 271 aa  80.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  28.79 
 
 		 266 aa  80.5  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  33.33 
 
 		 268 aa  79.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.53 
 
 		 265 aa  80.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 		 314 aa  79.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  34.23 
 
 		 279 aa  79.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  30.05 
 
 		 260 aa  79.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  29.23 
 
 		 272 aa  79  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.64 
 
 		 291 aa  79  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  31.25 
 
 		 266 aa  78.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  27.92 
 
 		 271 aa  78.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  29.3 
 
 		 301 aa  78.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  29.89 
 
 		 278 aa  78.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  31.32 
 
 		 268 aa  78.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.21 
 
 		 270 aa  78.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  30.28 
 
 		 264 aa  78.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  32.91 
 
 		 270 aa  78.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  31.4 
 
 		 268 aa  77.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  29.85 
 
 		 268 aa  77.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  32.02 
 
 		 265 aa  77.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  29.21 
 
 		 272 aa  77.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  29.3 
 
 		 267 aa  77.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  29.3 
 
 		 267 aa  77.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  28.42 
 
 		 273 aa  77  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  29.67 
 
 		 307 aa  76.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  31.06 
 
 		 267 aa  75.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.18 
 
 		 268 aa  75.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  29.62 
 
 		 338 aa  75.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  28.74 
 
 		 272 aa  75.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  28.96 
 
 		 277 aa  75.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  30.82 
 
 		 270 aa  75.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.36 
 
 		 267 aa  76.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.06 
 
 		 267 aa  75.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  29.79 
 
 		 260 aa  75.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.65 
 
 		 270 aa  75.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  30.49 
 
 		 267 aa  75.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  29.35 
 
 		 268 aa  75.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  29.67 
 
 		 338 aa  75.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  30.77 
 
 		 297 aa  75.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.49 
 
 		 267 aa  75.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  30.77 
 
 		 297 aa  75.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  29.3 
 
 		 267 aa  75.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  31.67 
 
 		 273 aa  75.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.11 
 
 		 329 aa  74.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  30.11 
 
 		 328 aa  74.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.64 
 
 		 297 aa  74.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  30.13 
 
 		 297 aa  74.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 		 270 aa  74.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.83 
 
 		 271 aa  74.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  30.13 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.81 
 
 		 267 aa  73.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  29.49 
 
 		 297 aa  73.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  30.43 
 
 		 270 aa  73.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  29.48 
 
 		 282 aa  72.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  29.48 
 
 		 282 aa  72.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  29.48 
 
 		 282 aa  72.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.83 
 
 		 276 aa  72.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>