89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62569 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_62569  Origin recognition complex, subunit 1  100 
 
 		 795 aa  1627    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.605443 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01207  origin recognition complex subunit Orc1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10720)  36.61 
 
 		 796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03440  replication control protein 1, putative  32.14 
 
 		 711 aa  214  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191379  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  32.83 
 
 		 784 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45115  predicted protein  33.65 
 
 		 1834 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544677  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37384  predicted protein  22.97 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0256729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0976  cell division control protein 6  28.68 
 
 		 414 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29170  cell cycle control protein  23.12 
 
 		 514 aa  92  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01260  DNA clamp loader, putative  26.04 
 
 		 834 aa  90.5  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309008  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05676  cell division control protein Cdc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04310)  24.57 
 
 		 612 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1733  cell division control protein 6  27.37 
 
 		 411 aa  88.6  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.78 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.974406  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0586  AAA ATPase  25.91 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1452  cell division control protein 6  26.45 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1233  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.44 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  27.48 
 
 		 396 aa  80.1  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01340  DNA clamp loader, putative  23.95 
 
 		 801 aa  78.2  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0389151  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  25.83 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.07 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00890369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1613  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.89 
 
 		 591 aa  67.8  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0001  AAA ATPase  24.62 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.42 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.810382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.79 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1930  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.35 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2471  AAA ATPase, central region  23.8 
 
 		 424 aa  63.9  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.68 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0001  cell division control protein 6 family protein  23 
 
 		 400 aa  62  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5104  AAA ATPase  24.77 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0815  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.93 
 
 		 516 aa  62  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00880215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1843  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.53 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0001  AAA ATPase  24.13 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.801297  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42584  predicted protein  20.73 
 
 		 1107 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277806  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5210  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.19 
 
 		 408 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2559  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.42 
 
 		 339 aa  55.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3217  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.5 
 
 		 334 aa  55.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0701  AAA ATPase  23.99 
 
 		 410 aa  55.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00101638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3152  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.89 
 
 		 395 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2694  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.88 
 
 		 340 aa  55.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3916  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.18 
 
 		 410 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2958  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.56 
 
 		 408 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  23.69 
 
 		 812 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3539  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.53 
 
 		 487 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0510  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.49 
 
 		 417 aa  52  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3249  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.57 
 
 		 447 aa  51.2  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.139401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.67 
 
 		 394 aa  50.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.226569  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2833  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.79 
 
 		 410 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0918  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.35 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1155  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.4 
 
 		 427 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3512  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.33 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3320  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.12 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2323  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.95 
 
 		 430 aa  50.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1254  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.58 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05892  origin recognition complex subunit Orc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11170)  20.86 
 
 		 742 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  23.83 
 
 		 783 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1683  cell division control protein 6 family protein  27.59 
 
 		 439 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1524  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.26 
 
 		 400 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0824685  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  24.47 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1887  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.31 
 
 		 336 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  24.47 
 
 		 776 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3760  ORC complex protein Cdc6/Orc1  24.41 
 
 		 435 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00211875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3641  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.57 
 
 		 410 aa  48.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  24.47 
 
 		 776 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  24.47 
 
 		 776 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  24.47 
 
 		 776 aa  47.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  23.95 
 
 		 773 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  23.93 
 
 		 775 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 775 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  24.41 
 
 		 776 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  22.98 
 
 		 783 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  22.92 
 
 		 773 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0706  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.32 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  24.02 
 
 		 776 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2143  cell division control protein 6  22.13 
 
 		 370 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  22.41 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  24.05 
 
 		 776 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  23.21 
 
 		 798 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  23.63 
 
 		 798 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  24.05 
 
 		 773 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4912  Sigma 54 interacting domain protein  20.13 
 
 		 452 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  23.29 
 
 		 797 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2997  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.09 
 
 		 499 aa  45.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  24.42 
 
 		 343 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00218707  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.13 
 
 		 759 aa  45.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  23.73 
 
 		 782 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  22.46 
 
 		 785 aa  44.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  22.13 
 
 		 786 aa  44.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  24.1 
 
 		 804 aa  44.3  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  22.5 
 
 		 806 aa  43.9  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>