96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0001 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  100 
 
 
420 aa  868    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00890369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0001  AAA ATPase  78.44 
 
 
430 aa  674    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0001  AAA ATPase  78.1 
 
 
427 aa  680    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.801297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2471  AAA ATPase, central region  73.51 
 
 
424 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  67.98 
 
 
425 aa  554  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1452  cell division control protein 6  57.32 
 
 
414 aa  461  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0976  cell division control protein 6  57.82 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1733  cell division control protein 6  57.11 
 
 
411 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  54.18 
 
 
557 aa  455  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.810382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1613  orc1/cdc6 family replication initiation protein  53.95 
 
 
591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0815  orc1/cdc6 family replication initiation protein  53.03 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00880215  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  47.29 
 
 
415 aa  363  4e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.974406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  48.09 
 
 
396 aa  345  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1233  orc1/cdc6 family replication initiation protein  47.7 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  60.57 
 
 
618 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1930  orc1/cdc6 family replication initiation protein  60.79 
 
 
652 aa  342  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0586  AAA ATPase  44.22 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0001  cell division control protein 6 family protein  38.52 
 
 
400 aa  277  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3963  orc1/cdc6 family replication initiation protein  37.24 
 
 
420 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5210  orc1/cdc6 family replication initiation protein  36.46 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0510  orc1/cdc6 family replication initiation protein  36.08 
 
 
417 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3152  orc1/cdc6 family replication initiation protein  37.13 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3760  ORC complex protein Cdc6/Orc1  36.03 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00211875  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2958  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.04 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0918  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.31 
 
 
459 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1843  orc1/cdc6 family replication initiation protein  35.81 
 
 
413 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  36.01 
 
 
449 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3916  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.77 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3320  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.53 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2747  orc1/cdc6 family replication initiation protein  32.28 
 
 
442 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2833  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.23 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3641  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.69 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1524  orc1/cdc6 family replication initiation protein  35.29 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0824685  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3611  orc1/cdc6 family replication initiation protein  36.02 
 
 
408 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.014824  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5222  orc1/cdc6 family replication initiation protein  35.29 
 
 
401 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00704323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2323  orc1/cdc6 family replication initiation protein  32.43 
 
 
430 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1155  orc1/cdc6 family replication initiation protein  32.53 
 
 
427 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1078  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.05 
 
 
398 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2997  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.96 
 
 
499 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3367  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.82 
 
 
459 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2434  orc1/cdc6 family replication initiation protein  30.75 
 
 
427 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3512  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.78 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5244  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.2 
 
 
410 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1085  orc1/cdc6 family replication initiation protein  32.99 
 
 
399 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3539  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.4 
 
 
487 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3249  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.54 
 
 
447 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0701  AAA ATPase  32.37 
 
 
410 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00101638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.17 
 
 
394 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.226569  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4773  orc1/cdc6 family replication initiation protein  31.25 
 
 
448 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1814  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.98 
 
 
401 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135499  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4912  Sigma 54 interacting domain protein  30.13 
 
 
452 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2559  orc1/cdc6 family replication initiation protein  29.74 
 
 
450 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1077  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.42 
 
 
401 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1055  cell division control protein 6  27.35 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.15 
 
 
375 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.384575  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2631  cell division control protein 6  29.49 
 
 
375 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1831  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.51 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0892755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1200  cell division control protein 6  28.18 
 
 
373 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1604  cell division control protein 6  28.42 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00370034  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0368  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.34 
 
 
423 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3634  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.08 
 
 
376 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2065  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.74 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2021  cell division control protein 6  31.63 
 
 
374 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.377999  normal  0.256652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1254  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.93 
 
 
406 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0679  cell division control protein 6  25.58 
 
 
374 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.894829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2143  cell division control protein 6  26.27 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0669  cell division control protein 6  25.61 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.145991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1683  cell division control protein 6 family protein  24.87 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0445  cell division control protein 6  28.17 
 
 
374 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0002  cell division control protein 6  25.27 
 
 
390 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0871  AAA ATPase  27.89 
 
 
390 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0400  cell division control protein 6  23.97 
 
 
377 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.481947  normal  0.0700474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2046  cell division control protein 6  24.94 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1887  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.93 
 
 
336 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0265  cell division control protein 6  28.71 
 
 
437 aa  94  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.626816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1725  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.96 
 
 
339 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0659  cell division control protein 6  25.85 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.733498  normal  0.0101732 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0001  cell division control protein 6  23.56 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5104  AAA ATPase  27.42 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37384  predicted protein  24.85 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0256729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0923  cell division control protein 6  23.96 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01207  origin recognition complex subunit Orc1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10720)  27.97 
 
 
796 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0706  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.24 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3217  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.68 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  30.08 
 
 
784 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62569  Origin recognition complex, subunit 1  25.07 
 
 
795 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.605443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0005  cell division control protein 6  22.6 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03440  replication control protein 1, putative  27.91 
 
 
711 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2694  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.88 
 
 
340 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29170  cell cycle control protein  24.01 
 
 
514 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1622  AAA ATPase  24.26 
 
 
356 aa  59.7  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45115  predicted protein  27.62 
 
 
1834 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544677  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3972  ORC1/cdc6 family replication initiation protein  28 
 
 
148 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640933  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05676  cell division control protein Cdc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04310)  24.02 
 
 
612 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  24.32 
 
 
322 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0446  AAA ATPase  22.03 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.399111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>