70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03440 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03440  replication control protein 1, putative  100 
 
 
711 aa  1452    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191379  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01207  origin recognition complex subunit Orc1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10720)  31.62 
 
 
796 aa  247  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62569  Origin recognition complex, subunit 1  33.83 
 
 
795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.605443 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  35.29 
 
 
784 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45115  predicted protein  32.7 
 
 
1834 aa  154  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544677  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37384  predicted protein  25.99 
 
 
442 aa  110  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0256729  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05676  cell division control protein Cdc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04310)  26.05 
 
 
612 aa  98.6  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1733  cell division control protein 6  28.25 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.27 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.974406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1452  cell division control protein 6  27.34 
 
 
414 aa  79  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29170  cell cycle control protein  23.27 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1233  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.24 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  26.8 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.58 
 
 
449 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0976  cell division control protein 6  27.88 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1843  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.42 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1524  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.7 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0824685  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0586  AAA ATPase  27.6 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.14 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00890369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  23.39 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05892  origin recognition complex subunit Orc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11170)  24.76 
 
 
742 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1930  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.86 
 
 
652 aa  64.7  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1613  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.86 
 
 
591 aa  64.3  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  34.65 
 
 
557 aa  64.3  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.810382 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3760  ORC complex protein Cdc6/Orc1  26.09 
 
 
435 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00211875  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01340  DNA clamp loader, putative  25.07 
 
 
801 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0389151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  33.07 
 
 
618 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0001  cell division control protein 6 family protein  22.83 
 
 
400 aa  62.4  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3320  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.93 
 
 
422 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2471  AAA ATPase, central region  25.29 
 
 
424 aa  61.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0001  AAA ATPase  25.37 
 
 
430 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3641  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.23 
 
 
410 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0815  orc1/cdc6 family replication initiation protein  32.28 
 
 
516 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00880215  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2833  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.23 
 
 
410 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3916  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.45 
 
 
410 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42584  predicted protein  24.71 
 
 
1107 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277806  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3249  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.81 
 
 
447 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5210  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.81 
 
 
408 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2323  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.88 
 
 
430 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0001  AAA ATPase  24.91 
 
 
427 aa  57.4  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.801297  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5222  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.91 
 
 
401 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00704323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2559  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.33 
 
 
450 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1155  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.36 
 
 
427 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3611  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.59 
 
 
408 aa  54.7  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.014824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0400  cell division control protein 6  24.16 
 
 
377 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.481947  normal  0.0700474 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3512  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.1 
 
 
429 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2747  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.19 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1831  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.44 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0892755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3152  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.51 
 
 
395 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1683  cell division control protein 6 family protein  21.77 
 
 
439 aa  52  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2021  cell division control protein 6  21.79 
 
 
374 aa  51.2  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.377999  normal  0.256652 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3539  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.01 
 
 
487 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3217  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.45 
 
 
334 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5244  orc1/cdc6 family replication initiation protein  20.9 
 
 
410 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0510  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.19 
 
 
417 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2434  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.87 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0003  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.89 
 
 
394 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.226569  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4912  Sigma 54 interacting domain protein  22.11 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5104  AAA ATPase  22.96 
 
 
343 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3963  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.76 
 
 
420 aa  47.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0871  AAA ATPase  25 
 
 
390 aa  47.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1814  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.09 
 
 
401 aa  47.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.135499  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0265  cell division control protein 6  23.9 
 
 
437 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.626816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1078  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.07 
 
 
398 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01260  DNA clamp loader, putative  26.69 
 
 
834 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1077  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.98 
 
 
401 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1085  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.27 
 
 
399 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0368  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.67 
 
 
423 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364207  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2958  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.5 
 
 
408 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1254  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.78 
 
 
406 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>