41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29170 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_29170  cell cycle control protein  100 
 
 
514 aa  1044    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05676  cell division control protein Cdc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04310)  31.32 
 
 
612 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37384  predicted protein  27.7 
 
 
442 aa  148  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0256729  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  27.45 
 
 
784 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01207  origin recognition complex subunit Orc1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10720)  25.55 
 
 
796 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62569  Origin recognition complex, subunit 1  23.12 
 
 
795 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.605443 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45115  predicted protein  22.75 
 
 
1834 aa  83.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544677  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01260  DNA clamp loader, putative  24.34 
 
 
834 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309008  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03440  replication control protein 1, putative  22.93 
 
 
711 aa  72  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0976  cell division control protein 6  23.24 
 
 
414 aa  67  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  24.33 
 
 
396 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1452  cell division control protein 6  24.25 
 
 
414 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1233  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.04 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.26 
 
 
415 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.974406  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5210  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.94 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0001  ORC complex protein Cdc6/Orc1  22.36 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1524  orc1/cdc6 family replication initiation protein  28.21 
 
 
400 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0824685  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.01 
 
 
420 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00890369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2471  AAA ATPase, central region  22.89 
 
 
424 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3320  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.73 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0001  AAA ATPase  23.78 
 
 
430 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3539  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.66 
 
 
487 aa  60.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1733  cell division control protein 6  21.37 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3611  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.04 
 
 
408 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.014824  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2958  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.25 
 
 
408 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.15 
 
 
557 aa  57.4  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.810382 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01340  DNA clamp loader, putative  24.27 
 
 
801 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0389151  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0001  AAA ATPase  23.08 
 
 
427 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.801297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0586  AAA ATPase  25.37 
 
 
396 aa  53.9  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1613  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.36 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0815  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.01 
 
 
516 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00880215  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3152  orc1/cdc6 family replication initiation protein  23.97 
 
 
395 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  26.59 
 
 
449 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1843  orc1/cdc6 family replication initiation protein  27.44 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0510  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.18 
 
 
417 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2323  orc1/cdc6 family replication initiation protein  22.85 
 
 
430 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3760  ORC complex protein Cdc6/Orc1  23.79 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00211875  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0001  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.66 
 
 
618 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1930  orc1/cdc6 family replication initiation protein  25.66 
 
 
652 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0918  orc1/cdc6 family replication initiation protein  24.78 
 
 
459 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2997  orc1/cdc6 family replication initiation protein  21.4 
 
 
499 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>