217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44096 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44096  predicted protein  100 
 
 
547 aa  1115  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10175  predicted protein  32.19 
 
 
419 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.101651  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.39 
 
 
713 aa  164  4e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.14 
 
 
730 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68261e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.52 
 
 
730 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.52 
 
 
730 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.09 
 
 
730 aa  157  5e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.23 
 
 
756 aa  153  6e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  29.27 
 
 
389 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.48 
 
 
750 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  30.19 
 
 
376 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  28.87 
 
 
375 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  31.23 
 
 
762 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.56 
 
 
725 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  1.88031e-11 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.05 
 
 
725 aa  149  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.83 
 
 
734 aa  149  2e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  29.37 
 
 
376 aa  149  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  31.79 
 
 
380 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.41 
 
 
738 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  28.6 
 
 
388 aa  146  8e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.55 
 
 
711 aa  142  2e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  29.93 
 
 
374 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.02 
 
 
712 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  28.07 
 
 
387 aa  138  3e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  31.03 
 
 
398 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  28.96 
 
 
391 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  26.53 
 
 
374 aa  137  6e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  30.07 
 
 
393 aa  136  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.56 
 
 
722 aa  135  2e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  29.29 
 
 
381 aa  134  4e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.44 
 
 
712 aa  132  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.93 
 
 
708 aa  131  4e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.57 
 
 
738 aa  131  4e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.57 
 
 
712 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.23 
 
 
711 aa  129  1e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00641  RNA methylase family protein  27 
 
 
374 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  28.6 
 
 
395 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  30.45 
 
 
729 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00621  RNA methylase family protein  26.53 
 
 
374 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.51 
 
 
709 aa  127  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  31.37 
 
 
380 aa  126  8e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  28.84 
 
 
375 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  28.3 
 
 
484 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.11 
 
 
711 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.86 
 
 
711 aa  124  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  28.37 
 
 
387 aa  124  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.64 
 
 
721 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.09 
 
 
713 aa  123  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  26.74 
 
 
375 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  26.74 
 
 
375 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.09 
 
 
713 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.09 
 
 
713 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.15 
 
 
701 aa  123  1e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.91 
 
 
711 aa  122  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1344  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.72 
 
 
732 aa  122  2e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.15 
 
 
708 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.98 
 
 
702 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  27.19 
 
 
374 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.28 
 
 
709 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.28 
 
 
709 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.28 
 
 
709 aa  120  5e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.93 
 
 
807 aa  120  5e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.85 
 
 
705 aa  120  5e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.28 
 
 
709 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  25.83 
 
 
399 aa  119  1e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  24.65 
 
 
749 aa  119  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.34 
 
 
718 aa  119  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.77 
 
 
702 aa  119  2e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.81203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.72198e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.66949e-05  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.18 
 
 
702 aa  118  2e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  31.27 
 
 
702 aa  119  2e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.16 
 
 
718 aa  117  4e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.99 
 
 
752 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.82 
 
 
706 aa  117  8e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.9 
 
 
768 aa  117  8e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00611  RNA methylase family protein  26.89 
 
 
374 aa  116  9e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  27.73 
 
 
385 aa  116  9e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.82 
 
 
707 aa  116  1e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.86 
 
 
705 aa  116  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.35 
 
 
711 aa  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.89 
 
 
702 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.89 
 
 
702 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.63679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.89 
 
 
702 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.89 
 
 
702 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  28.4 
 
 
393 aa  115  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.17 
 
 
715 aa  115  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.5 
 
 
702 aa  115  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.37 
 
 
705 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.42 
 
 
711 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  25.81 
 
 
374 aa  114  4e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.67 
 
 
776 aa  114  4e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  27.21 
 
 
395 aa  113  7e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.06959e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  29.37 
 
 
374 aa  112  2e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.16 
 
 
725 aa  112  2e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.02 
 
 
706 aa  112  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>