50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10363 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10363  predicted protein  100 
 
 		 50 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  48.98 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  42 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01050  30S ribosomal protein S18, putative  39.58 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0265013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0061  ribosomal protein S18  34 
 
 		 73 aa  44.3  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.854939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3294  ribosomal protein S18  38 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  38 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  42 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  32 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 79 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  42 
 
 		 75 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  46 
 
 		 92 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  42 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1217  30S ribosomal protein S18  34 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.86687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  44 
 
 		 71 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 81 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 73 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  54.76 
 
 		 88 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 79 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2341  ribosomal protein S18  36 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.159544 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  38 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0417  ribosomal protein S18  38 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  38.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  36 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  54.76 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  34 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  38 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  32 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  32 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1465  ribosomal protein S18  38 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4118  30S ribosomal protein S18  32 
 
 		 79 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3889  30S ribosomal protein S18  32 
 
 		 79 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0224203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  40 
 
 		 71 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>