277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2068 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
152 aa  314  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
185 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
139 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
133 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.31 
 
 
131 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  37.1 
 
 
143 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  36.3 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  41.6 
 
 
131 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  40.94 
 
 
130 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  39.53 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  34.07 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  38.17 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.8 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  38.58 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  43.48 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  34.35 
 
 
488 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  38.76 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  0.000000246532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  35.34 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  35.62 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  32.84 
 
 
464 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  37.3 
 
 
451 aa  82  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  40.8 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  35.11 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  33.81 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  32.06 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.4 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  35.48 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  30.77 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  35.94 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  36.22 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.71 
 
 
437 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  31.39 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  33.57 
 
 
490 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1065  rfaE bifunctional protein  32.37 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  31.85 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  31.61 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  38.14 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  32.39 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  34.59 
 
 
479 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.71 
 
 
477 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  30.77 
 
 
455 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  29.87 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  32.37 
 
 
487 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  31.91 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  32.37 
 
 
487 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  37.93 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.99 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1813  rfaE bifunctional protein  29.77 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  31.65 
 
 
491 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0244  bifunctional protein HldE  33.33 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  29.5 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  28.57 
 
 
484 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  33.59 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  32.73 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  34.02 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  31.16 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0461  rfaE bifunctional protein  31.01 
 
 
464 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.640202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  30.08 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  34.38 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  30.57 
 
 
371 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  31.62 
 
 
386 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0786  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.01 
 
 
481 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  33.33 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  32.64 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  29.37 
 
 
461 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  27.94 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3038  cytidyltransferase-like protein  34.31 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  33.68 
 
 
488 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  31.16 
 
 
167 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  33.68 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  29.63 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0834  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  33.09 
 
 
475 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  30.47 
 
 
457 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1616  bifunctional ADP-heptose synthase  29.41 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0715  rfaE bifunctional protein  31.25 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.970718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  32.35 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1184  rfaE bifunctional protein  28.69 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  31.3 
 
 
472 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0361  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.17 
 
 
516 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.88 
 
 
476 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  29.79 
 
 
490 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3563  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.58 
 
 
478 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  30.83 
 
 
150 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  28.78 
 
 
488 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2277  rfaE bifunctional protein  27.66 
 
 
163 aa  60.5  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3404  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.58 
 
 
478 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0578  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  30.65 
 
 
461 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  30.66 
 
 
486 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  30.37 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>