29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0648 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  100 
 
 		 391 aa  820    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  36.69 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  33.24 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  35.82 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  31.29 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  31.27 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  32.49 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  29.23 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  28.05 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.53 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.98 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  21.81 
 
 		 396 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.57 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  20.97 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  20.36 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  20.7 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  18.75 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  23.42 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  20.45 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.29 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  20.45 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>