More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4629 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  100 
 
 
443 aa  909    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  59.77 
 
 
436 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  59.54 
 
 
436 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  52.44 
 
 
412 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  48.17 
 
 
430 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  48.17 
 
 
430 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  45.29 
 
 
427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  33.93 
 
 
439 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
444 aa  209  9e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
454 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  32.02 
 
 
457 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  34.16 
 
 
454 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  34.16 
 
 
454 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
436 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.67 
 
 
469 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  41.09 
 
 
443 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
469 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
475 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.48 
 
 
461 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
419 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
475 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  32.85 
 
 
336 aa  170  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  33.77 
 
 
429 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  27.87 
 
 
412 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.41 
 
 
486 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  27.24 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.74 
 
 
481 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  29.59 
 
 
416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  29.59 
 
 
416 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  29.59 
 
 
416 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
470 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
406 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  35.63 
 
 
392 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
438 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  37.89 
 
 
432 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  27.63 
 
 
416 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.92 
 
 
490 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
466 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.51 
 
 
469 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
436 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  36.73 
 
 
337 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  34.06 
 
 
436 aa  156  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  29.64 
 
 
438 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
475 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
416 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.54 
 
 
477 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  27.03 
 
 
416 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.29 
 
 
486 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
585 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2968  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
439 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000115911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
392 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
420 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
403 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
815 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  34.23 
 
 
518 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.7 
 
 
527 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
422 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
469 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
469 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
504 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
457 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000859237  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  27.27 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  35.83 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  40.35 
 
 
510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
585 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
587 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2161  sensor histidine kinase  34.44 
 
 
444 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
418 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
448 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  36.84 
 
 
501 aa  144  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
509 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  33.19 
 
 
589 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  38.72 
 
 
436 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  37.39 
 
 
448 aa  143  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  34.6 
 
 
252 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  37.44 
 
 
587 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  38.39 
 
 
463 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  37.89 
 
 
587 aa  143  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  37.89 
 
 
587 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1717  phosphate regulon sensor protein  34.6 
 
 
252 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0057387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  38.56 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  38.72 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  37.44 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  38.72 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  37.44 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>