67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3708 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  356  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  97.06 
 
 		 170 aa  349  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000939538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  75.88 
 
 		 170 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  74.71 
 
 		 170 aa  276  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  69.75 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  69.94 
 
 		 170 aa  248  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  71.78 
 
 		 187 aa  246  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  71.17 
 
 		 170 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  71.17 
 
 		 187 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  69.14 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  69.14 
 
 		 165 aa  237  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  69.14 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  68.52 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  68.52 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  68.52 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  68.52 
 
 		 165 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  234  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000006136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  67.9 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  68.92 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000227359  hitchhiker  0.0000931266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  55.32 
 
 		 161 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  53.1 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  52.48 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  50.33 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  48.47 
 
 		 188 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  49.67 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0545  protein of unknown function DUF335, SprT  52.31 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3442  hypothetical protein  46.45 
 
 		 201 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000887757  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4132  protein of unknown function DUF335 SprT  47.1 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  48.34 
 
 		 191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0834  hypothetical protein  45.81 
 
 		 206 aa  150  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3330  hypothetical protein  45.81 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0277435  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  44.64 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0692  hypothetical protein  45.81 
 
 		 201 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000345273  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  47.4 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  46.71 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0843  protein of unknown function DUF335 SprT  45.75 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0209179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  45.75 
 
 		 218 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3159  protein of unknown function DUF335, SprT  50 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000619203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0811  protein of unknown function DUF335 SprT  45.75 
 
 		 219 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000376161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0836  protein of unknown function DUF335 SprT  45.1 
 
 		 219 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00977603  hitchhiker  0.0000107184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  44.27 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01642  hypothetical protein  40.79 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  44.52 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  40.27 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  38.19 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  0.000000135384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  38.46 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  39.44 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2966  hypothetical protein  35.62 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0041354  normal  0.102756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0864  hypothetical protein  43.88 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  38.19 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  35.81 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  34.44 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  34.44 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  33.77 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000128773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1552  protein of unknown function DUF335, SprT  37.96 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0472621  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  38.97 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1712  protein of unknown function DUF335, SprT  37.4 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  34.62 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 198 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1439  protein of unknown function SprT  35.14 
 
 		 193 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1875  hypothetical protein  43.75 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>